Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CrxO54751 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms