Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FxnO35943 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FxnO35943 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms