Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cited2O35740 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms