Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpna6O35345 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Kpna6O35345 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Kpna6O35345 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna6O35345 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpna6O35345 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Kpna6O35345 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Kpna6O35345 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Kpna6O35345 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpna6O35345 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms