Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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