Protein–RNA interactions for Protein: O08644

Ephb6, Ephrin type-B receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb6O08644 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ephb6O08644 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ephb6O08644 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms