Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sec22bO08547 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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