Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm2056J3QQ02 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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