Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Smim18J3QNP2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smim18J3QNP2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
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