Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm21976J3QNN2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm21976J3QNN2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm21976J3QNN2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21976J3QNN2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms