Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc180J3QNE4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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