Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm3415J3QMS8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms