Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c3J3QJW5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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