Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Farp1F8VPU2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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