Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3371F7CQW8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3371F7CQW8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms