Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Gm20538F6Z9R1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms