Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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