Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmod3E9QA62 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms