Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm20518E9Q548 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20518E9Q548 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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