Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Pdzd2E9Q1M1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Pdzd2E9Q1M1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms