Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fndc1E9Q043 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms