Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gcom1E9PZ54 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms