Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brd1E9PZ26 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brd1E9PZ26 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms