Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Srp54bE9PXC0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Srp54bE9PXC0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Srp54bE9PXC0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Srp54bE9PXC0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Srp54bE9PXC0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srp54bE9PXC0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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