Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3002E9PW72 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3002E9PW72 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms