Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clca3bE9PUL3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms