Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SafbD3YXK2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms