Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Samd1D3YXK1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Samd1D3YXK1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms