Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rfx8D3YU81 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfx8D3YU81 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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