Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5483B2RV77 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5483B2RV77 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms