Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rd3lB2RV38 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms