Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc8B2RUS7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc8B2RUS7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms