Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms