Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprbB2RU80 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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PtprbB2RU80 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprbB2RU80 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms