Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf3B2KF05 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms