Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Rtf1A2AQ19 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtf1A2AQ19 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Rtf1A2AQ19 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtf1A2AQ19 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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