Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Scn1aA2APX8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn1aA2APX8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn1aA2APX8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Scn1aA2APX8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn1aA2APX8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms