Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CtcflA2APF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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