Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lcn6A2AJB9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Lcn6A2AJB9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lcn6A2AJB9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lcn6A2AJB9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lcn6A2AJB9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms