Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramel3A2AHA7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms