Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ckap5A2AGT5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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