Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc163A2AGD7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms