Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Prdm16A2A935 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Prdm16A2A935 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm16A2A935 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm16A2A935 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prdm16A2A935 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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