Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm17190V9GX38 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm17190V9GX38 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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