Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Top3bQ9Z321 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Top3bQ9Z321 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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