Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtmr1Q9Z2C4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms