Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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