Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ap3b1Q9Z1T1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3b1Q9Z1T1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms