Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VarsQ9Z1Q9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VarsQ9Z1Q9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms