Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a4Q9WV27 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms